В настоящее время уровень рентабельности проектной продукции не регламентируется, т.к. при разработке Справочников были использованы обобщенные данные о затратах на производство проектной продукции ведущих проектных организаций, имеющих различную структуру затрат и рентабельность. Для каждой проектной организации значение показателя рентабельности при определении стоимости проектных работ будет индивидуальным в зависимости от сложившегося уровня её затрат, в т.ч. и отчисления на заработную плату инженерам-проектировщикам, загрузки и других факторов.

В соответствии с п. 11 приложения № 2 к приказу Федеральной налоговой службы от 30 мая 2007 г. № ММ-3-06/333@ «Об утверждении Концепции системы планирования выездных налоговых проверок» (в ред. Приказов ФНС России от 14.10.2008 № ММ-3-2/467@, от 22.09.2010 № ММВ-7-2/461@, от 08.04.2011 № ММВ-7-2/258@, от 10.05.2012 № ММВ-7-2/297@) значительное отклонение уровня рентабельности по данным бухгалтерского учета от уровня рентабельности для рассматриваемой сферы деятельности по данным статистики может использоваться налоговыми органами при планировании выездных налоговых проверок, как на предстоящий, так и последующие годы до их очередной актуализации.

Расчет рентабельных продаж по основным видам экономической деятельности, начиная с 2006 года, приведен в приложении № 4 к приказу Федеральной налоговой службы от 30 мая 2007 г. № ММ-3-06/333@ (в ред. от 10.05.2012 № ММВ-7-2/297@) и в соответствии с официальной публикацией на сайте ФНС России приведен по состоянию на 17 сентября 2014 года. При этом рентабельность продукции, работ, услуг организаций по виду экономической деятельности «Научные исследования и разработки» за 2014 год составляет 9,1%. К указанному виду деятельности, по нашему мнению, относятся и проектные работы.

Вместе с тем, исходя из имеющихся в распоряжении ОАО «ЦЕНТРИНВЕСТпроект», данных по анализу результатов деятельности проектных организаций, следует полагать, что уровень прибыли по отношению к себестоимости может составлять порядка 10 – 15 % (максимальный уровень 20 %), учитывая значительный рост материальных затрат проектных организаций, связанный с ростом цен, отчислений от фонда оплаты труда, ростом этого фонда и т.п. При этом размер накладных расходов и прибыли так же не регламентируется.