Не корректно ставить вопрос о том, какой документ приоритетней, речь можно вести только об отдельных частях документов, отвечающих за блок требований.

В вашем случае:

• некоторые пункты СП 120.13330.2012 Метрополитены входят в обязательный перечень Постановления 1521,
• в свою очередь СП 10.13130.2009 Системы противопожарной защиты. Внутренний противопожарный водопровод. Требования пожарной безопасности входит только в добровольные перечни.

Осталось определиться с применяемыми пунктами, одни из них будут обязательные, другие добровольные. 

Так СП 120.13330.2012 указан в пункте 68 Постановления правительства РФ № 1521. 

Применение на добровольной основе СП 10.13130.2009 не противоречит №184-ФЗ «О техническом регулировании» и способствует улучшению пожаробезопасности проектируемого здания в пределах своего действия.